Os órgãos de gestão do ISCSP-ULisboa são:
- O Conselho de Escola;
- O Presidente;
- O Conselho Científico;
- O Conselho Pedagógico;
- O Conselho de Gestão.
A constituição e eleição dos representantes dos vários órgãos é feita de acordo com as diretrizes estabelecidas pelos Estatutos do ISCSP e publicadas em Diário da República.