O ISCSP desenvolve actividades de investigação e de desenvolvimento através de três unidades reconhecidas pela Fundação de Ciência e Tecnologia, o Centro Interdisciplinar de Estudos de Género (CIEG), o Centro de Administração e Políticas Públicas (CAPP) e o Instituto do Oriente (IO), o primeiro com a classificação de excelente, o segundo com a classificação de muito bom e o terceiro com a classificação de bom.