O ISCSP adota no seu Sistema de Gestão da Qualidade (SGQ) a abordagem por processos, identificando e gerindo os procedimentos praticados, bem como a sequência e interação entre estes, promovendo uma maior transparência nas atividades realizadas, uma melhor comunicação e interação entre diferentes unidades funcionais e uniformizando os objetivos a atingir. Esta abordagem por processos baseia-se no ciclo PDCA a partir do qual se identifica e define um conjunto de atividades relacionadas, assim como os recursos necessários para um desempenho adequado, e sua monitorização e avaliação.
A articulação entre o Sistema de Gestão do ISCSP-ULisboa e o Sistema de Gestão da Qualidade, traduz-se, essencialmente, através dos seus documentos de suporte.